Le génome humain est contenu dans les 46 chromosomes dont l'ADN est composé de 3 milliards de "paires de base de nucléotides", A (adénine) avec T (thymine), et G (guanine) avec C (cytosine). Le génome est constitué de régions codantes, les gènes, et des régions non-codantes. Les gènes peuvent présenter plusieurs versions codantes (situés sur des sites spécifiques d'un ou plusieurs chromosomes) que l'on appelle allèles.
Les chromosomes sexuels sont soit une paire XX pour une femme soit une paire XY pour un homme. Ils permettent à une mère de transmettre que des chromosomes X et à un père de transmettre un chromosome X ou Y. Le chromosome Y possède 60 millions de paires de base, le chromosome X 153 millions.
L’ADN chromosomial humain est un assemblage de la moitié des gènes de la mère et de la moitié des gènes du père. Mais l'ADN chromosomial Y est toujours transmis par le père.
A côté de l'ADN des chromosomes, il existe aussi un autre ADN qui se trouve en dehors du noyau de la cellule, dans les mitochondrie, l'ADN mitochondrial, constitué de seulement 16.569 paires de base. Et ces mitochondries ne sont transmises que par la mère.
Une mutation d'une seule paire de base est appelée un SNP (single nucleotide polymorphism). Les haplogroupes humains sont définis par des SNP sur des groupes d'allèles particuliers ou haplotype. Ces mutations sont des caractéristiques individuels. Et on peut suivre la transmission de ces haplotypes particuliers en suivant les 2 types d'ADN qui permettent de retracer distinctement les lignées paternelles et maternelles.
les haplogroupes définissant le chromosome Y (Y-ADN) toujours hérité de père en fils qui renseigne sur les ancêtres de la lignée agnatique ou patrilinéaire.
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les haplogroupes définissant ceux de l'ADN mitochondrial (ADN mt), toujours hérité de la mère qui renseigne sur la lignée cognatique ou matrilinéaire.
http://www.eupedia.com/europe/origines_haplogroupes_europe.shtml